dc.contributor |
Universidade Federal de Santa Catarina |
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dc.contributor.advisor |
Santos, Elisandro Ricardo Drechsler |
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dc.contributor.author |
Fernandes, Mariana |
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dc.date.accessioned |
2018-05-11T17:26:33Z |
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dc.date.available |
2018-05-11T17:26:33Z |
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dc.date.issued |
2017 |
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dc.identifier.other |
350538 |
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dc.identifier.uri |
https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/186183 |
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dc.description |
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2017. |
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dc.description.abstract |
Phellinotus é um gênero pertencente à Hymenochaetaceae, caracterizado por produzir basidiomas perenes, pileados, aplanadas a unguladas, com uma distinta linha negra resinosa que divide o contexto. Micromorfologicamente, não apresenta setas, mas possui sistema hifal monomítico no contexto e dimítico na trama himenoforal, os basidiósporos elipsoides, de coloração amarelo-pálido, de paredes expessadas, xantocróicas e ventralmente achadados. Geograficamente, Phellinotus está restrito à região Neotropical. Dentre as espécies, Phellinotus piptadeniae foi descrita em 1950, por Teixeira, a partir de espécimes encontrados parasitando Piptadenia gonoachanta, o pau jacaré (fabaceae), espécie vegetal frequentemente encontrada na Mata Atlântica. O presente trabalho apresenta elementos para compreender as bases populacionais dessa espécie de fungo parasita facultativo, na Ilha de Santa Catarina. Para tal, foram feitas coletas em sete localidades (uma no norte da ilha, uma no Sul da ilha e cinco na região central), de onde foram extraídos DNA total de 74 espécimes coletados em hospedeiro vivo de pau jacaré. Marcadores usados foram ATP6, ITS, RPB2, EF1-??e ??TUB, obtendo-se 48, 43, 35, 21, 12 sequências respectivamente. O tratamento dos dados se deu a partir de análises baseadas na diversidade de haplótipos, diversidade de nucleotídeos, testes de neutralidade e Mismatch Distribution. Os resultados indicam que os organismos estão em pammixia na ilha de Santa Catarina. Não há estruturação, o que significa que existe uma única população. Há evidências de que, embora haja fluxo gênico entre os indivíduos coletados nas diferentes localidades, a população passou por um evento de redução de indivíduos e se encontra em expansão. A população apresenta alta diversidade haplotípica e baixa diversidade nucleotídica. A hipótese de expansão recente teve suporte com o resultado significativo do Teste Fs de Fu & Li para um dos marcadores usados (ATP6), indo ao encontro do perfil da curva unimodal encontrada, que também reitera a hipótese de expansão. Os demais marcadores (RPB2, EF1-?, e ?-TUB) não tiveram quantidades de sequencias suficientes para as análises e ITS não demostrou resultados estatisticamente significativos. Porém, a amostragem pode ter tido significativa influência visto que qualquer mutação já diminuiria o valor dos testes estastísticos pois a quantidade de sequcncias usadas foram baixas. |
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dc.description.abstract |
Abstract : Phellinotus is a genus belonging to Hymenochaetaceae, characterized by perennial basidiomata, pileate, flattened to ungulate, with a distinct black resinous line that divides the context. Micromorphologically, Phellinotus does not present setae, but it has a monomythic hifal system in the context and dimytic hifal system in the hymeniae, ellipsoid, pale yellow thick walled, xanthocroic and ventrally diseased basidiospores. Geographically, Phellinotus is restricted to the Neotropical region. Among the species, Phellinotus piptadeniae was described in 1950 by Teixeira, from specimens found parasitizing Piptadenia gonoachanta, a species frequently found in the Atlantic Forest. The present work presents elements to understand the population bases of this fungus species belonging to Hymenochaetaceae, on the Island of Santa Catarina. For this, the basidiomata was collected in seven locations along the Island of Santa Catarina (one in the north, one in the South and five in the central region of the Island). Were extracted total DNA of 74 specimens, all collected in a live host. The PCR reaction was made with molecular markers for five gene regions (ATP6, ITS, RPB2, EF1-? and ??TUB), yielding 48, 43, 35, 21, 12 sequences respectively for each of these markers. The treatment of the data was based on analyzes based on the diversity of haplotypes, nucleotide diversity, neutrality tests and Mismatch Distribution. The results indicate that the organisms are in pammixia on the island of Santa Catarina. There is no structuring, which means that there is only one population. There is evidence that, although there is gene flow among the individuals collected in the different localities, the population underwent an event of reduction of individuals and is in expansion. The population presents high haplotypic diversity and low nucleotide diversity. The recent expansion hypothesis was supported by the significant result of the Fu Fs Test for one of the used markers (ATP6), meeting the profile of the unimodal curve found, which also reiterates the hypothesis of expansion. The remaining markers (RPB2, EF1-? and ?-TUB) did not have sufficient sequence numbers for the analyzes and ITS did not demonstrate statistically significant results. However, sampling may have had significant influence since any mutation already decreases the value of the tests. |
en |
dc.format.extent |
114 p.| il., gráfs., tabs. |
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dc.language.iso |
por |
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dc.subject.classification |
Biologia |
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dc.subject.classification |
Piptadenia |
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dc.subject.classification |
Variação (Genética) |
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dc.subject.classification |
Genética de populações |
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dc.title |
Diversidade genética de Phellinotuspiptadeniae (Teixeira) Drechsler-Santos & Robledo na Ilha de Santa Catarina |
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dc.type |
Dissertação (Mestrado) |
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dc.contributor.advisor-co |
Klabunde, Gustavo Henrique Ferrero |
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