Caracterização da comunidade microbiana do sedimento marinho da costa de Santa Catarina em diferentes profundidades.

Abstract

O litoral de Santa Catarina encontra-se em sua maior parte dentro da Plataforma Continental Sudeste do Brasil (PCSE) e o entendimento sobre os microrganismos presentes no habitat marinho, principalmente nesta região, ainda é muito escasso. Assim, realizou-se uma análise do sedimento de diferentes pontos de coleta com a finalidade de avaliar como os fatores físico-químicos, o distanciamento da linha de costa e a profundidade dos sedimentos influenciam na estruturação da comunidade microbiana. As análises foram realizadas em sedimentos coletados próximo à Garopaba-SC e ao Arquipélago de Moleques do Sul. O estudo foi realizado através de métodos moleculares baseados na análise do gene RNAr 16S das populações presentes em cada ambiente, especificamente com uso da técnica de eletroforese em gel de gradiente desnaturante (DGGE). Os resultados obtidos neste trabalho permitiram concluir que, embora os parâmetros físico-químicos dos sedimentos sejam similares entre si conforme a profundidade, a comunidade microbiana se estrutura inicialmente conforme a localidade, e em seguida pela profundidade do sedimento. Além disso, parâmetros físico-químicos como salinidade, pressão e saturação de oxigênio estão correlacionados com as amostras mais profundas em Moleques, enquanto a comunidade microbiana de Garopaba está mais correlacionada à temperatura da água. Os resultados deste trabalho contribuíram para melhor compreensão da comunidade microbiana em sedimentos marinhos, sobretudo na região da costa Sul do Brasil, onde há uma escassez de estudos de forma geral.

The coast of Santa Catarina is mostly within the Southeast Continental Shelf of Brazil (PCSE), and the understanding of microorganisms present in the oceanic habitat and especially in this region is very scarce. Thus, an analysis of the sediment from different collection points was carried out in order to evaluate how the physical-chemical factors, the distance from the coastline and the depth of the points cause variation in the bacterial community structure. The analysis was made on marine sediments sampled close to Garopaba-SC and the Moleques do Sul Archipelago. This comparison was made using molecular methods based on the analysis of the 16S rRNA gene of the species present in each environment, specifically using a denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) approach. The results obtained in this work showed that, despite the physicochemical parameters clustered among each other as a function of depth, the microbial community structure clustered primarily due to the sediment location, and secondly due to sediment depth. In addition, physicochemical parameters such as salinity, pressure and oxygen saturation are directly correlated with deeper sediments in Moleques, while the microbial community in Garopaba was correlated with water temperature. The results of this work contribute to a better understanding of the microbial community of marine sediments, specially in the southern coast of Brazil, where there is a lack of studies in general.