Reconstituição da via NRF2 em câncer de pulmão por técnica de CRISPR/Cas9

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Reconstituição da via NRF2 em câncer de pulmão por técnica de CRISPR/Cas9

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Title: Reconstituição da via NRF2 em câncer de pulmão por técnica de CRISPR/Cas9
Author: Zancanaro, Helena Souza
Abstract: O câncer de pulmão está entre os mais comuns e letais em todo o mundo e, entre as mutações que caracterizam essa doença, cerca de 30% dos pacientes apresentam mutações e amplificações em genes da via do fator de transcrição NRF2 (gene NFE2L2 ) ( Nuclear factor (erythroid - derived 2) - like 2 ) ou seu inibidor KEAP1 ( Kelch - like - ECH associated protein 1 ). O NRF2 confere um fenótipo de resistência à agentes alquilantes e compostos de platina por esses tumores, e uma sobrevida menor dos pacientes com esse subtipo tumoral. Essa proteção tumoral mediada por NRF2 é dependente de enzimas de síntese de GSH (glutationa), TXNRD1 (tioredoxina redutase 1) e dentre outros, componentes que possuem papel na homeostase redox e/ou detoxificação de xenobióticos. Para o seu estud o e de suas vias, utilizam - se inibidores de NRF2, porém o seu tempo de inibição é restrito e a consequência de sua ação também pode demorar para acontecer, por não eliminar o NRF2 que foi sintetizado anteriormente ao silenciamento. Assim, o uso de técnicas para “ knockout ” ou deleção de NRF2, como o CRISPR/Cas9, podem ser úteis para o estudo dos fenótipos tumorais associados a mutações nesta via. Dessa forma, o objetivo deste projeto de pesquisa foi a validação de protocolo para knockout de NFE2L2, utilizand o sistema CRISPR/Cas9, em linhagem de câncer de pulmão de células não - pequenas, A549, de modo a reduzir a ativação dessa via. Nos clones celulares geneticamente modificados, serão avaliados os fenótipos de proliferação e migração celular, a sua resistência a diversos quimioterápicos de uso clínico e potenciais terapias alvo baseadas em sistema redox, em relação à linhagem A549 mutante para a via NRF2. No projeto foi utilizado o plasmídeo PX458 (Addgene), que já contém a Cas9 em sua estrutura. Até então o pr otocolo está parcialmente estabelecido: a digestão do plasmídeo com a enzima BbsI (Thermo), por meio de eletroforese, e sua purificação usando o kit QIAquick Gel Extraction Kit (QIAGEN), pela quantificação de DNA no equipamento NanoDrop, foram confirmadas. A etapa de transformação das bactérias, feita com base no protocolo do fabricante, foi efetiva, com crescimento bacteriano nas placas com o plasmídeo clonado com o guia e adição do antibiótico Ampicilina, o que evidencia que o gene de resistência à ampici lina do plasmídeo está sendo expresso pela bactéria e, portanto, que o plasmídeo está funcional. Para confirmação da inserção do guia no plasmídeo o PCR de colônia foi realizado, utilizando - se um primer forward específico para o plasmídeo PX458 e o próprio gRNA reverse como primer reverse da reação. Vimos a presença do guia em todas as colônias, já que houve amplificação do gRNA reverse , marcada com a banda na região de 100pb. Contudo, ainda não se tem certeza de que o gRNA forward foi inserido, por isso pr osseguiremos ao sequenciamento, a fim de confirmar que os dois guias estão inseridos no plasmídeo.
URI: https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/250200
Date: 2023-08-04


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