Desenvolvimento de marcadores moleculares microssatélites para duas espécies de bromélias endêmicas e ameaçadas do estado de Santa Catarina.

Abstract

O projeto Aplicação de plataformas NGS Oxford Nanopore e Illumina em análises de genômica estrutural e funcional em espécies nativas da Mata Atlântica tem como foco a preservação de duas espécies ameaçadas de extinção em Santa Catarina: Dyckia brevifolia e Dyckia ibiramensis. Através do uso de marcadores microssatélites, estudamos a reprodução e adaptação dessas plantas. O projeto conta com a orientação do Prof. Dr. Valdir Marcos Stefenon.

A primeira etapa envolve o isolamento do DNA, onde as amostras foliares passam por uma série de processos químicos e mecânicos para extrair o DNA puro. Após a extração, realizamos a prospecção dos loci microssatélites, utilizando ferramentas computacionais para identificar regiões do DNA que servem como marcadores. A validação desses marcadores é feita através de experimentos laboratoriais que confirmam sua eficiência e precisão.

Durante o projeto, desenvolvi dois softwares. O CertiBase compara informações genéticas de diferentes plantas, utilizando marcadores microssatélites para identificar semelhanças entre cultivares. O CaCrEst calcula o carbono armazenado nas árvores, auxiliando no entendimento da contribuição das árvores na mitigação das mudanças climáticas. Ambos os softwares já estão em processo de publicação científica.

Além disso, participei da montagem e configuração de computadores para análises de bioinformática, incluindo a avaliação de peças, substituição, instalação de novos componentes, formatação de sistemas operacionais e atualização de programas utilizados nas pesquisas.