Análise da transcrição gênica diferencial em ostras Crassostrea gasar de diferentes colorações de conchas: identificação das bases genéticas potencialmente envolvidas na pigmentação

Abstract

O cultivo de ostras com diferentes fenótipos para coloração de concha tem se tornado uma alternativa em programas de seleção genética para a intensificação da produção e venda de ostras. A ostra nativa Crassostrea gasar possui elevado potencial de cultivo no Brasil e, recentemente a seleção dessas ostras nativas com diferentes colorações de conchas de variedades douradas, pretas e listradas vem sendo realizados em programas de melhoramento genético. Portanto, o objetivo desse trabalho foi avaliar o perfil transcricional das ostras nativas Crassostrea gasar com diferentes colorações de conchas e identificar as possíveis vias metabólicas envolvidas na pigmentação. Análises de RNA-Seq do manto das ostras de cores clara, escuras e marrom foram executas e os genes anotadas comparativamente aos genomas da ostra do Pacífico Magallana gigas e da ostra americana Crassostrea virginica. A base de dados Gene Ontology foi utilizada para identificação de termos ontológicos padronizados em processos biológicos, componentes celulares e funções moleculares potencialmente associados ao metabolismo de pigmentação e a base de dados KEGG foi aplicada para o mapeamento de vias metabólicas responsivas a pigmentação do manto e das conhas nas ostras Crassostra gasar. Os resultados transcritômicos dos genes diferencialmente expressos induzidos e reprimidos em relação ao valor de p ajustado < 0,05 e Log2 Fold Change > |1,0| foram 134 induzidos e 36 reprimidos do transcritoma de manto escuro sobrepondo o manto claro e 40 induzidos e 18 reprimidos do transcritôma de manto escuro sobrepondo o manto. Foram encontradas 164 vias metabólicas foram encontradas no transcritoma de manto escuro sobrepondo o manto claro e 15 vias metabólicas resultantes no transcritoma de manto escuro sobrepondo o manto marrom, entre elas a melanogênese e endocitose escolhidas como potencialmente envolvidas na pigmentação de diferentes colorações de manto e conchas para o melhoramento genético da ostra nativa Crassostrea gasar. Diante disso, os genes PML, CALM3, CALM-like, RHOQ, GNAL, CAV1 e TYR-like localizados nessas vias metabólicas de melanogênese e endocitose serviram de subsídios para a compreensão do metabolismo de pigmentação do manto e das conchas.