EASY DATA & MATCHI Sistema de armazenamento e análise de dados biológicos

Abstract

Os sistemas computacionais contribuem em diversas áreas tais como em Bancos com sistemas de automação Bancária, RH de empresas com sistemas de folhas de pagamentos, em Universidades com sistemas de Controle Acadêmico e Biblioteca com a proposta de melhorar e otimizar processos. Em uma dessas áreas, a biológica, mais especificamente ade Análises Clínicas, são úteis para viabilizar a organização de dados experimentais e a análise de suas correlações de forma rápida e confiável. Dessa maneira, o objetivo geral deste trabalho foi o desenvolvimento de um sistema de computação de base de dados (EasyData) para a organização de informações obtidas em um estudo de metagenômica, que empregou sequenciamento de terceira geração (NGS) para análise de amostras clínicas de pacientes hospitalizados e ambientais. No banco de dados, foram inseridas e organizadas informações sobre microrganismos, genes de resistência aos antimicrobianos, dados geográficos e temporais sobre amostras clínicas e ambientais coletadas, bem como referentes aos antimicrobianos utilizados na clínica e na criação animal. Adicionalmente, foi desenvolvido outro sistema de computação (Matchi) associado ao EasyData, que por sua vez tem por objetivo efetuar análises combinatórias entre os dados armazenados. Para isso foram utilizados dados resultantes de coletas efetuadas em ambientes de granjas orgânicas do Oeste de Santa Catarina, em transportes de saúde do oeste para leste de SC e de amostras clínicas de pacientes do HU/UFSC/EBSERH. Como resultados obtivemos a criação dos 2 sistemas (Easydata e Matchi), permitindo assim classificar, organizar e relacionar informações as informações produzidas, bem como selecionar informações de interesse utilizando os filtros disponíveis nos sistemas.

Computational systems contribute in several areas such as in Banks with Banking automation systems, HR of companies with payroll systems, in Universities with Academic Control and Library systems with the proposal to improve and optimize processes. In one of these areas, biological, more specifically Clinical Analysis, are useful to enable the organization of experimental data and the analysis of their correlations quickly and with reliably. Thus, the general objective of this work was the development of a database computing system (EasyData) for the organization of information obtained in a metagenomics study, which used Next-Generation Sequencing (NGS) for analysis of clinical samples of hospital and environmental patients. In the database, information on microorganisms, antimicrobial resistance genes, geographic and temporal data on clinical and environmental samples collected, as well as on antimicrobials used in the clinic and in animal husbandry, were inserted and organized. Additionally, another computing system (Matchi) associated with EasyData was developed, which in turn aims to perform combinatorial analyzes between the stored data. For this, data resulting from collections carried out in organic farms in western Santa Catarina, in health transport from west to east of SC and from clinical samples of patients from HU/UFSC/EBSERH were used. As a result, we obtained the creation of 2 systems (Easydata and Matchi), thus allowing to classify, organize and relate information to the information produced, as well as select information of interest using the filters available in the systems.